菌种保藏的基本原理是使微生物的代谢作用降至极低限度,使其处于不活泼的休眠状态。从微生物本身来讲,就是要挑选典型菌种的优良纯种,最好采用它们的休眠体(如分生孢子、芽孢等),如有孢子或芽孢的微生物,要在它们生出孢子或芽孢后再进行保藏;从环境条件来讲,则是创造一个适合其长期休眠的环境条件,诸如低温、干燥、缺氧、避光、缺乏营养以及添加保护剂或酸度中和剂等。大多数菌种保藏的方法都是根据这些因素或其中部分因素而设计的。
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