小麦秆黑粉病发生与小麦发芽期土温有关，土温9～26℃均可侵染，但以土温20℃左右最为适宜。此外发病与否、发病率高低均与土壤含水量有关，一般干燥地块较潮湿地块发病重，西北地区10月份播种的发病率高，品种间抗病性差异明显。
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