小冬瓜的花为雌雄异花同株,少数品种为两性花。雌花和雄花都各有5片花瓣,花瓣黄色,花4钟形、5裂,边缘为锯齿形、反卷、绿色。雌花的雄蕊退化,雌蕊的花柱短,柱头成瓣状.3裂、浅黄色、花柄短,子房绿色,着生在花冠下面,称为子房下位。子房上有银白色茸毛,子房的形状因品种而不同:具有该品种成熟果实的雏形,即圆形果实的品种,它的子房是圆形的;长椭圈形的品种,它的子房是长椭圆形的。雄花的雌蕊退化.雄蕊3枚,花柄较长。
植株一般先发生雄花,后发生雌花。雌雄开放时间均在每天上午摇水干后,晴天上午为7-9点;如遇阴雨天,湿度大或沮度低时,则延迟到10点以后开放。开花期较短,一般24小时后花冠自然凋谢,柱头变褐,逐渐丧失发芽授粉能力。在花药开放的前1天,花粉粒就具有发芽能力,可以进行授粉受梢,但受精能力最强的时期是在花盛开的时期。在进行人工授粉或杂交时,必须掌握这一良机。
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