防治措施：农业措施： ①选用无病种子或耐病品种。加强小麦种子检疫检验，严禁从病区调运或串换麦种；在全蚀病发生区，严禁种植感病品种。 ②进行轮作倒茬。在重病区轮作倒茬是减轻全蚀病危害的有效措施，零星病区轮作可延缓病害扩展蔓延。实行1-2年与大豆、蔬菜、甘薯及其它非寄主作物轮作。 ③适期晚播。在适宜播期内，可适当推迟播期5-7天。 ④推广配方肥，增施有机肥。在化肥施用上应注意控氮、增磷、补钾、配微，提高植株抗病性，减轻病害的发生。
化学防治：1、对于小麦全蚀病不论是否包衣种子，均应采取防治全蚀病的专用拌种剂进行拌种，可用12.5%全蚀净200毫升兑水5公斤水，拌麦种100公斤，堆闷2-8小时，晾干播种。主要针对全蚀病发生田。全田零星发病的麦田必须在造墒后，可选用50％多菌灵1公斤＋15%粉锈宁1公斤＋100公斤水，随水灌入土中或喷于地表，然后翻耕整地，或亩用50%多菌灵或70%甲基托布津2公斤＋100公斤水喷于地表或兑细土50公斤撒于地表，翻耕整地。亩用50%多菌灵3公斤或70%甲基托布津2公斤＋100公斤水喷于地表，然后翻耕再播种。2、于小麦播种20--30天即3叶期，用20%三唑酮750--1000倍顺垅喷雾。返青期再喷一次。即结合拌种、土壤处理等措施，多措并举控制小麦全蚀病的发生与蔓延。
小麦全蚀病多由种子带菌或土壤带菌所致。小麦播种后，在11月病菌开始浸染小麦根部，提前进行预防和关注小麦全蚀病的动态，是非常重要的。
轮作倒茬经调查，不同的种植类型，小麦全蚀病的发生程序存在着较大的差异，连作麦田病害重，尤以小麦—玉米—小麦连作田最重；因为玉米是小麦全蚀病病菌的寄主，为小麦全蚀病的传播起到了桥梁的作用。从国外资料看，通过轮作可控制小麦全蚀病的发生，特别是与非禾本科作物轮作可有效减轻或控制小麦全蚀病的发生，因为小麦全蚀病病菌不易在非禾本科作物上寄生。推荐轮作方案：小麦—山芋—油菜—花生—小麦；小麦—大豆—冬闲—棉花—小麦；小麦—芝麻—油菜—夏玉米—小麦。因全蚀病菌在土壤中的存活期超过1年，故轮作年限在1年以上才会有效。
（一）农业防治措施
1．深耕深翻。小麦全蚀病的寄居菌以菌丝遗留在土壤表层，深翻土层，把细菌深埋地下，会有效杀死细菌。
2．减少菌源。对于零星发病区，坚持就地封锁，就地消灭。发病田要单收单打，所收小麦严禁留种，且麦秆、麦糠不能直接还田，最好高茬收割，然后把病茬连根拔掉焚烧，不能沤肥用，以尽量减少菌源。
3．合理轮作。对于严重发生小麦全蚀病的地块，可实行轮作换茬，推行麦菜、麦棉等轮作，以切断全蚀病菌源积累，控制病情的发展。
4．合理施肥。底肥增施有机肥、生物肥，提高土壤有机质的含量。化肥施用应注意氮、磷、钾的配比。
（二）药剂防治措施
1、土壤处理。播种前可亩用70%甲基托布津可湿性粉剂2-3全面质量管理公斤拌细土20～30公斤，耕地时均匀撒施，如防治地下害虫，可与杀虫剂混用，要求随撒随耕。
2、浸拌种。可用12.5％全蚀净（美国孟山都公司生产），亩用量20克，拌8～10公斤种子，闷种6～12小时，晾干后播种。
3、在小麦拔节期间，每亩用15%粉锈宁可湿性粉剂150－200克，或20%三唑酮乳油100－150毫升，兑水50－60千克喷浇麦田，防效可达60%左右，加入600－800倍粮食专用型“天达2116”可明显提高防治效果。
4、药剂灌根。小麦返青期，施用蚀敌或消蚀灵每亩100～150毫升、对水150千克灌根。
用以上预防方法连续使用2～3年便可从根本上达到基本消除小麦全蚀病。
1、土壤处理。播种前可亩用70%甲基托布津可湿性粉剂2-3全面质量管理公斤拌细土20～30公斤，耕地时均匀撒施，如防治地下害虫，可与杀虫剂混用，要求随撒随耕。
2、浸拌种。可用12.5％全蚀净（美国孟山都公司生产），亩用量20克，拌8～10公斤种子，闷种6～12小时，晾干后播种。
3、在小麦拔节期间，每亩用15%粉锈宁可湿性粉剂150－200克，或20%三唑酮乳油100－150毫升，兑水50－60千克喷浇麦田，防效可达60%左右，加入600－800倍粮食专用型“天达2116”可明显提高防治效果。
4、药剂灌根。小麦返青期，施用蚀敌或消蚀灵每亩100～150毫升、对水150千克灌根。
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