药残对人的危害：
（1）毒性作用如磺胺类可引起肾脏损害，氯霉素可引起再生障碍性贫血，诱发白血病发生，汞制剂中毒或产生蓄积性残留也会损害肾脏。
（2）过敏反应如青霉素、四环素、磺胺类、某些氨基糖甙类抗生素和呋喃类渔药都能引起人群的过敏反应，严重时可引起休克。
（3）“三致”(即致癌、致突变和致畸)作用如孔雀石绿和双甲脒都有致癌的作用，呋喃类药能引起人体细胞染色体突变和致畸，硝酸亚汞、醋酸汞等汞制剂都有较强的“三致”作用。
（4）产生耐药菌株水产品在服用抗生素后易产生耐药菌株，如果这些耐药菌株传递给人，将会给临床治疗带来很大困难。
（5）激素作用甲基睾丸酮、丙酸睾酮、19去甲睾酮等雄性激素，己烯雌酚、黄体酮等雌性激素，都会扰乱人体激素平衡，损害肝脏和肾脏，导致儿童性早熟、女性男性化或男性女性化，子宫内膜过度增生，诱发女性乳腺癌。
所以，上述毒性大的渔药已经禁止在生产中使用。
药残对环境的危害：
其一，渔药的原型物或其代谢物残留于水中会直接污染和破坏水域生态环境，一旦被人误饮，甚至会引起生命危险。
其二，渔药残留于水中对低等水生动物无疑是灭顶之灾，从而导致对渔药敏感的种群数量减少，甚至灭绝。
其三，有助于耐药菌株的传递。同时那些易挥发的制剂如二氧化氯、三氯异氰尿酸等所挥发的有害气体，一旦被人吸入，则易刺激呼吸道黏膜，引起肺和支气管的病变。