熟料栽培平菇发菌期可以采用微孔发菌，但在扎口前，培养室必须消毒，而且扎口用的工具也要用0.15％高锰酸钾消毒之后扎孔。一般在菌种菌丝封面后，在封面处扎孔，扎孔深度0.5~1厘米。污染菌袋不能进行扎孔。
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