是深根作物，番茄根系发达，分布广而深，根深可达1.5米，根群横向分布直径可达1.7米。但根系主要分布在30厘米的耕层内。番茄的根系再生能力强，当主根被截断时易产生侧根，因而育苗期幼苗移植或移栽后易缓苗，成活率高。
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