脐腐病主要是低温阶段氮肥施用过多，影响钙的吸收所引起的生理性病害。西红柿开花期土壤水分不稳定，忽干忽湿也能引发病害发生。苗期少施氮肥，后期以磷钾肥为主，开花结果期经常保持土壤湿润。用1%过磷酸钙或1%氯化钙的水液，隔10－15天向植株叶片上喷雾，共喷2次，在傍晚时施用更有利于叶面吸收。
番茄脐腐病的病根是施化肥太多，尤其是施氮肥太多了。在番茄施氮量上，凡是超过30公斤/亩纯氮以后，发病率就会严重。所以，一要控制氮肥用量。在番茄底肥中以腐熟的有机肥加磷、钾化肥，如用普钙和硫酸钾或者用中氮、中磷富钾的复合肥做底肥。在基肥和追肥的比例上，增加追肥中的氮肥，减少基肥氮的比例。二要合理灌溉，防止大水漫灌。在第一穗果膨大前要控水促根，在番茄果实膨大期及时适量灌溉，保持土壤湿润状态而又不积墒过多或通气不良；冬季灌水后及时通风，降低空气湿度，促进植株蒸腾，有利于番茄对钙的利用。三要采用叶面和根部补钙相结合。叶面补钙是从第一穗花期开始，每隔一周喷一次0.5%～1%的硝酸钙。根部补钙是在基肥中施用普钙代替磷铵或施硝酸钙10公斤/亩。通过以上方法基本上避免了番茄脐腐病的发生。
一是复地膜。保持土壤水分相对稳定，保证水分供应均衡，可以预防发病。二是适时灌水。灌水应在上午8-9时，下午3-4时进行。尤其在结果期更需注意水分的供应。三是根外追肥。西红柿座果后一个月内是吸收钙素的关键时期，可喷洒1%过磷酸钙或0.1氯化钙或0.1%硝酸钙。从初花期开始，隔15天1次，连续喷2次。
1．浇足定植水，保证花期及结果初期有足够的水分供应。在果实膨大后，应注意适当给水。
2．育苗或定植时要将长势相同的放在一起，以防个别植株过大而缺水，引起脐腐病。
3．选用抗病品种。番茄果皮光滑、果实较尖的品种较抗病，在易发生脐腐病的地区可选用。
4．地膜覆盖可保持土壤水分相对稳定，能减少土壤中钙质养分淋失。
5．使用遮阳网覆盖，减少植株水分过分的蒸腾，也对防治此病有利。
6．采用根外追施钙肥技术。番茄及甜(辣)椒结果后1个月内，是吸收钙的关键时期。可喷洒1%的过磷酸钙，或0．5%氯化钙加5mg/kg萘乙酸、0.1%硝酸钙及爱多收6000倍液，或绿芬威3号1000--1500倍液。从初花期开始，隔10--15d1次，连续喷洒2--3次。使用氯化钙及硝酸钙时，不可与含硫的农药及磷酸盐(如磷酸二氢钾)混用，以免产生沉淀。