（1）在配制培养料时，严格控制含水量，在子实体生长阶段，避免菇床上长时间积水。
（2）搞好菇房环境卫生，适时通风透气，控制空气相对湿度不超过95%。
（3）化学防治 发现有病菇，及时清除，后喷洒1：500倍的25%多菌灵或1：800倍的70%甲基托布津，或1：500倍的65%代森锌。常用药剂 ：多菌灵、甲基托布津、代森锌。
通过以上关于金针菇基腐病怎么防治的介绍，我们现在知道了金针菇基腐病的防治方法，金针菇的种植在平时要注意各方面的管理，管理方法合理后不但可以提高产量，同时也可以防止病虫害的出现。