甘薯黑斑病是由甘薯长喙壳菌侵染引起，病菌以厚垣孢子和子囊孢子在贮藏窖或苗床及大田的土壤内越冬，或以菌丝体附在种薯上越冬，成为次年初侵染的来源。病菌主要从伤口侵入，发病温度10-30℃，最适宜发病温度为25-28℃，低于10℃、高于35℃时不发生；地势低洼、阴湿、土质粘重利于发病。
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