辣椒产生畸形果的原因大致有几个方面的原因，即植株徒长、土壤性状、温度不适、干旱缺水、光照不足、根系异常、缺素症等情况，都会发生畸形果现象。因此，要详细观察，知道产生畸形果的真正原因，才能“缺啥补啥”，有针对性的去预防。
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