主要危害茎基部或地下主侧根，病部开始为暗褐色，以后绕茎基部扩展一周，使皮层腐烂，地上部叶片变黄、萎蔫，后期整株枯死，病部表面常形成黑褐色大小不一的菌核。
番茄茎基腐病的病原为半知菌亚门真菌：立枯丝核菌 。病菌在土壤中越冬，腐生性强，可以在土中生存2-3年，大水漫灌且遇到地温过高最易发病。
预防：
A、将青枯立克按600倍液稀释，每平米3升在播种前或播种后及栽前苗床浇灌。
B、在定植时或定植后和预期病害常发期前，将青枯立克按600倍液稀释，进行灌根，每7天用药1次，用药次数视病情而定。或用土传一冲净稀释600-800倍液灌根，每株灌药液100毫升。
治疗：
A、稀释倍数：《青枯立克》按500倍液稀释使用，病害严重时，可适当加大用药量。
B、用药方法：《青枯立克》对病株及病株周围2～3米内植株进行灌根或小面积漫灌；若病原菌同时为害地上部分，应在根部灌药的同时，地上部分同时进行喷雾，每5天用药1次。或用土传一冲净稀释600-800倍液灌根，每株灌药液100-200毫升，间隔5-7天使用两次。
（1）选用抗病品种。
（2）培育无病壮苗。育苗期苗床换新土或用甲醛：高锰酸钾=2:1对土壤消毒。育苗时先用55℃水浸种10-15分钟，然后用0.1%高锰酸钾浸种后播种。定植时要注意剔除病苗，幼苗定植时不宜过深，雨天及时排除地上积水，培土不宜过高。
（3）定植前清除田间病残体，同时深耕，结合浇水撒施多菌灵、百菌清等广谱性杀菌剂。
（4）加强田间管理。与非茄科作物实行3年以上轮作。切忌大水漫灌，发现地温过高，扒开茎基部土壤晾晒。
（5）定植后发病，可在茎基部施用药土：每平方米表土，施40%拌种双可湿性粉剂9克，充分混匀后，把病部埋上，促其在病斑上方长出不定根。
（6）发病初期可用《青枯立克》500倍液进行灌根。
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