典型的病理变化为喉和气管黏膜充血和出血。喉部黏膜肿胀，并覆盖黏液性分泌物，有时呈干酪样假膜，可将气管完全堵塞。炎症也可扩散到支气管、肺、气囊、眶下窦。比较缓和的病例，仅见结膜和眶下窦内上皮的水肿及充血。
喉气管型：最具特征性病变在喉头和气管。在喉和气管内有卡他性或卡他出血性渗出物，渗出物呈血凝块状堵塞喉和气管。或在喉和气管内存有纤维素性的干酪样物质。呈灰黄色附着于喉头周围，很容易从粘膜剥脱，堵塞喉腔，特别是堵塞喉裂部。干酪样物从粘膜脱落后，粘膜急剧充血，轻度增厚，散在点状或斑状出血，气管的上部气管环出血。
鼻腔和眶下窦粘膜也发生卡他性或纤维素性炎。粘膜充血、肿胀，散布小点状出血。有些病鸡的鼻腔渗出物中带有血凝块或呈纤维素性干酪样物。
产蛋鸡卵巢异常，出现卵泡变软、变形、出血等。
结膜型：有的病例单独侵害眼结膜，有的则与喉、气管病变合并发生。结膜病变主要呈浆液性结膜炎，表现为结膜充血、水肿，有时有点状出血。有些病鸡的眼睑，特别是下眼睑发生水肿，而有的则发生纤维素性结膜炎，角膜溃疡 .
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