栽培种培养基的种类很多，有谷粒培养基、棉籽壳培养基、木屑培养基、草料培养基等。谷粒培养基具有不易结块、接种速度快、菌丝不易受伤、接种后菌丝萌发快等优点，但成本较高，且不适于香菇、黑木耳、白灵菇、杏鲍菇、金针菇等种类。棉籽壳培养基、木屑培养基、草料培养基长满菌丝后容易结成块状，捣碎时菌丝容易受伤，但成本较低，原料易得。
不同食用菌种类对培养料的要求不完全相同，栽培种培养基以接近栽培生产的配方最好，以使接种后适应期短，生长速度快，可以缩短生产周期
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