历代本草著作中提到的“茱萸”有山茱萸、食茱萸和吴茱萸。古人在典集记录中常将“食茱萸”、“吴茱萸”不分，于是也有部分学者认为，食茱萸和吴茱萸指的是一个东西——茱萸。但细细分辨，二者在植株形态和药性上还是有差别的。1、食茱萸学名椿叶花椒，也叫樗叶花椒、满天星（江西），刺椒（四川）和食茱萸（台湾植物志），拉丁学名为Zanthoxylum ailanthoides Sieb. et. Zucc.，是芸香科落叶乔木，高可达15米，茎干有锐刺。椿叶花椒8~9月开花，10~12月结果，分果瓣淡红褐色，干后淡灰或棕灰色，常见于海拔500~1 500米山地杂木林中。
2、吴茱萸：别名：吴萸、茶辣、辣子、臭辣子、吴椒、臭泡子、食茱萸、越椒、樗叶花椒。小乔木或灌木，高3-5米，嫩枝暗紫红色，与嫩芽同被灰黄或红锈色绒毛，或疏短毛。生于平地至海拔1500米山地疏林或灌木丛中，多见于向阳坡地。种子呈球形或略呈五角状扁球形,直径2~5mm.表面暗黄绿色至褐色,粗糙,有多数点状突起或凹下的油点.顶端有五角星状的裂隙,基部残留被有黄色茸毛的果梗.质硬而脆,横切面可见子房5室,每室有淡黄色种子1粒.气芳香浓郁,味辛辣而苦.
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