水稻在长期淹水的情况下，土壤通气状况不良，氧气不足, 就会产生大量的还原性物质，如硫化氢和二价铁离子，当硫化氢和二价铁结合时，就生成了黑色的硫化亚铁，硫化亚铁沉积在根的表面，使根变成了黑色。所以，水稻黑根的产生归根结底是由于土壤通气状况不良造成的。
减少水稻发生黑根的办法：要注重水稻的栽培管理，秧田要尽量保持良好的通气状态，本田则应保持浅、湿、干交替或湿润状态，必要时还要晾田或晒田，以调节土壤的通气状况，从而减少黑根的发生。
（来源于百度百科）
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