苹果套袋时期应选择在果实生理落果后的6月下中旬，此时套袋既可避开果锈主要发生期和果实生理落果期，又可避开春旱时间以预防果实日灼，而在特殊干旱的月份，苹果套袋时间应推迟至7月上旬，避开初夏高温，防止日烧发生，或者在套袋前将整个园透水一次，以调节果园湿度；梨在5月上中旬疏果结束后套袋；葡萄在葡萄生理落果后，果粒长到豆粒大小时经疏粒、整穗后立即套袋。套袋时间以晴天上午9：00~11：00和下午2：00~6：00为宜。
套袋前将整捆套袋放于潮湿处，使之返潮、柔韧；选定幼果后，小心地除去附着在幼果上的花瓣及其他杂物，左手托住纸袋，右手撑开袋口，或用嘴吹开袋口，令袋体膨起，使袋底两角的通气放水孔张开，手执袋口下2~3CM处，袋口向上或向下，套入果实后使果柄置于袋的开口基部，然后从袋口两侧依次按“折扇”方式折叠袋口于切口处，将捆扎丝扎紧袋口于折叠处，于线口上方从连接点处撕开将捆丝返转90度，沿袋口旋转1周扎紧袋口，使幼果处于袋体中央，在袋内悬空，以防止袋体摩擦果面，不要将捆扎丝缠在果柄上。套袋时用力方向要始终向上，以免拉掉幼果，用力宜轻，尽量不碰触幼果，袋口也要扎紧，以免害虫爬入袋内危害果实和防止纸袋被风吹落。另外，树冠上部及骨干枝背上裸露果实应少套，以避免日烧病的发生。套袋顺序为先上后下、先里后外。
每667平方米的苹果套袋数量分别为：苹果和梨园7800个左右，桃园为6500个左右，葡萄园为1600个左右（巨峰系5000左右，红提为2000左右）。