海水鱼类使用的植物性饵料种类不多，主要是小球藻、扁藻，以及金藻、角毛藻等。其中除了金藻、角毛藻用于直接投喂文昌鱼的小苗和成鱼外，其他海水鱼类一般都不直接摄食植物性饵料。海水鱼类养殖中使用最多的是小球藻（微绿藻）和扁藻，尤其是小球藻。小球藻富含鱼类仔鱼、稚鱼时期必需的不饱和脂肪酸DHA和EPA，所以主要用来培育鱼苗必不可少的生物饵料——轮虫。
轮虫培育过程中经常使用酵母，但酵母中缺乏DHA和EPA，会使轮虫缺乏营养，因此必须用小球藻对轮虫进行营养强化。另外，小球藻会通过光合作用消耗水中的氨氮和二氧化碳，释放氧气，因此在养殖和育苗过程中，在育苗水体中添加小球藻会起到改善水质、调节水生态环境的作用.
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