霉心病菌大多是弱寄生菌,在苹果枝干、芽体等多个部位存活,也可在树体上及土壤等处的病僵果或坏死组织上存活,病菌来源十分广泛。第二年春季开始传播侵染,病菌随着花朵开放,首先在柱头上定殖,落花后,病菌从花柱开始向萼心间组织扩展,然后进入心室,导致果实发病。病果极易脱落,有的霉心果实因外观无症状而被带人贮藏库内,遇适宜条件将继续霉烂。
适宜该病害流行的气候条件是,冬季温暖、春季潮湿,春季阴湿天气持续时间较长,尤其是开花期遇低温多雨天气更有利于病害发生。地理条件是地势低洼潮湿的果园,密闭通风透光条件差的果园、管理粗放树势衰弱的果园发病重。
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