1、农业措施：选择无病毒的苗木；茎尖脱毒处理，培养脱毒苗木；杀死危害果树的昆虫，消灭传毒虫媒；在果园里操作时最好不要吸烟，以防烟草病毒的传播；果园里使用过的工具要进行晒太阳消毒，剪刀可以使用鲜牛奶消毒一分钟；铲除果园四周的杂草。
2、施肥：苹果树是一种产量高、需肥全面的树种之一，要求在果树大量结果后，全面均衡施肥，确保果树的生长正常。
建议每亩果园施底肥为：在亩产4000千克（公斤）以上的地块要使有机肥2000千克（公斤）（鸡粪要充分发酵处理，不可使用生鸡粪），氮磷钾三元复合肥200-300千克（公斤），硝酸钙15千克（公斤），石灰粉20千克（公斤）（可以消除土壤中过量的亚硝酸盐，不会改变土壤性质），硼酸1千克（公斤），硫酸锌2千克（公斤），硫酸亚铁20千克（公斤），将这些肥料混合均匀施入果树。
施肥时间，在果树落叶后冬天地冻之前或果树开花前地解冻之后为佳，开花后施肥已经晚了，对当年的果树已经不起作用。
近几年新研究的防治措施：
1、施入上述底肥的同时，采用最新研制的防治药剂综合预防和控制。
药剂防治：
对病株及病株周围的果树在萌芽期5天左右(枝条出现扭曲时)、花露红期、谢花后7-10天、套袋前、夏至后至秋分前（形成明年所有花芽和叶芽的关键时期，一般7月中旬前后）5个时期，分别使用《果树病毒1号》40克（主治花叶病毒）或《果树病毒Ⅱ号》（主治花脸病毒）30-50ml+纯牛奶200ml，兑水15公斤进行喷雾，可有效预防和控制果树病毒病。
其它防治措施：
A．栽培无病毒苗木。
B．增强果树树体抗性，土壤增施有机质，提高土壤肥力，改善土壤团粒结构，培育土壤有益微生物菌群，养根壮树。
C.合理负载、合理修剪，消除大小年现象；调整树体结构，保证园内风光良好，增强树势，提高树体抗病能力。
D．修剪时，应先剪健树再剪病树，并定时用大蒜擦拭剪刀消毒杀菌，以减少农事操作传播。
2、其它措施：果树发芽期易受到气候的影响，造成气温变化剧烈，低温和高温都会对树体造成伤害，为病毒感染创造机会。
（1）建议在气温低于6℃以下时，要在药液中加入防冷冻素500倍和0.3%红糖（先用少量水化开），喷洒苹果树全树，以预防低温授粉不良或冻害造成花芽受损。
（2）花期遇到温度超过23℃的高温时，要用有机硅钙素500倍，加0.3%食用醋混合均匀喷洒全树防止热害，保证花粉正常授粉。
（3）花期遇到持续连阴小雨或大雾天，就要采用腐烂灵500倍，加速克灵等药剂，防止苹果树花腐病、霉心病和畸形果。
（4）在苹果树生长期间，要多次喷洒有机硅钙素和海藻肥一类的叶面肥，适当的补充一些硅、碘等痕量元素。
（5）夏至以后正是苹果树孕育明年花芽的关键时期，要及时地为果树补充形成花芽的基本材料硼元素，具体方法是在6月22日至8月22日期间，要对苹果树喷洒两次高纯硼酸或硼砂（硼砂不溶于40℃以下的凉水），疏除多余的新萌生枝条，让树体通风透光，以促进果树形成大量有效花芽，为明年果树高产奠定良好的基础。
（6）苹果树在花量大的情况下，在花后七天就要追肥，选择含碘的喷洒质量稳定和效果较好的叶面肥和海藻冲施肥。