微生态制剂主要有三类：
一、乳酸菌类制剂
本类制剂添加后在肠道中内分解糖类产生乳酸，使肠道内酸度升高，抑制病原菌的存在，同时产生天然的抗生素类物质。
二、酵母类制剂
富含B族维生素和消化酶与核甘酸，能参与兔机体内蛋白质、脂肪和糖类的代谢，促进胃肠道发酵功能，增强兔的消化作用。
三、芽孢杆菌类制剂
多用蜡样芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌等制成。芽孢杆菌利用氧气的能力很强，它能大大消耗肠道内的氧气，造成肠道内厌氧环境，使需要氧的病原菌难以生存，而厌氧菌这类优势菌群则大量繁殖，从而抑制病原菌的生长。
微生态制剂应用于兔的生物学依据：健康的兔肠道内栖息着多种微生物，彼此之间相互依存、相互制约，维护着兔肠内微生态平衡及机体健康，当兔处于应激、消化紊乱、饲料改变、生长、抗生素治疗时期，会引起肠内菌群的变化，当应激超过其生理范围时，则引起消化道菌群失调，微生态平衡破坏，甚至再现出病理状态，造成兔的体质下降，死亡率上升。额外添加有益微生物，可以调节肠道内微生态的平衡，使肠道有益菌占优势，有害菌被抑制，维持兔体健康。
需要注意的是：微生态制剂应适宜添加，并不是越高越好，过高反而是一种应激。不同的微生态制剂应用于不同品种、年龄、健康状况的兔，须达到一定数量才能形成微生物的生物屏障，过多过少均达不到预期的效果，其适宜的课题有待进行规范化、标准化。
微生态制剂不是灵丹妙药，不能包治百病，对某些发生机理尚不清楚，尚无有效疗法的兔病，寄希望于微生态制剂来完全解决，是缺乏科学依据的。多种实验表明，微生态制剂的预防效果要好于治疗效果。在当前饲养环境及饲养技术仍不完善的条件下，抗生素在治疗疾病方面仍起作用。