黑番茄病害主要有脐腐病.青枯病.晚疫病.叶斑病.白粉病.病毒病等；虫害主要有根瘤线虫，西红柿夜蛾，蚜虫，茄螟等。生理性病害主要有缺硼引起的顶芽呈畸形或二芽对称并列发生等现象。病虫害与生理性病害主要以贯彻"预防为主，综合防治"的方针。根据当地的生产情况，进行有效的防治。
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