对该病目前尚无有效的治疗方法，所以预防是控制本病的唯一方法。由于Reo病毒本身的特点，加上现代养鸡的高密度，要防止鸡群接触病毒是困难的，因此，预防接种是目前条件下防止鸡病毒性关节炎的最有效方法。为了防止本病流行，在国外研制出了许多种弱毒苗和灭能的禽呼肠孤病毒疫苗，并制定了相应的免疫程序。目前国外应用的弱毒疫苗有通过鸡胚72代致弱的S-1133弱毒株，可饮水免疫30周龄或10~17周龄种鸡，其后代能抵抗经口攻毒；完全减毒疫苗P100苗，此苗是用S-1133毒株通过鸡胚传235代后，再通过鸡胚成纤维细胞培养100代致弱而成。P-100苗可用于1日龄雏鸡，皮下接种，经14日后免疫雏鸡能抵抗同源病毒的攻击。还有UMI-203弱毒苗，盖淼对8~18周龄的种鸡无致病力，但对雏鸡的毒力很强。该苗的优点是交叉免疫比S-1133株强，因其抗原性较宽。
由于雏鸡对致病性Reo病毒最易感，而至少要到2周龄开始才具有对Reo病毒的抵抗力，因此，对雏鸡提供免疫保护应是防疫的重点。接种弱的活疫苗可以有效地产生主动免疫，一般采用皮下接种途径。但用S-1133弱毒苗与马立克氏病疫苗同时免疫时，S1133会干扰马立克氏病疫苗的免疫效果，故两种疫苗接种时间应相隔5天以上。无母源抗体的后备鸡，可在6-8日龄用活苗首免，8周龄时再用活苗加强免疫，在开产前2～3周注射灭活苗，一般可使雏鸡在3周内不受感染。这已被证明是一种有效的控制鸡病毒性关节炎的方法。将活疫苗与灭活疫苗结合免疫种鸡群，可以达到很好的免疫效果。但在使用活疫苗时要注意疫苗毒株对不同年龄的雏鸡的毒性是不同的。
一般的预防方法是加强卫生管理及鸡舍的定期消毒。采用“全进全出”的饲养方式，对鸡舍彻底清洗和消毒，可以防止由上批感染鸡留下的病毒的感染。由于患病鸡长时间不断向外排毒，是重要的感染源，因此，对患病鸡要坚决淘汰。