选植株长势中等、刚开的大形雄花，连同花柄摘下，将花瓣外翻，露出雄蕊，将花粉轻轻涂抹在雌花柱头上。雌花应选子房大而花朵小，花梗弯曲粗长，柱头标准的。一朵雄花可给2~4朵雌花授粉。在雄花数量充足时，尽量多用雄花。 每根花粉管只能通向与其相应部分的子房和胚珠，一粒花粉只能为一粒种子受精，如果授粉偏于一侧，发育的种子也偏于一侧，就形成畸形瓜。种子有促进果实发育的作用，种子多瓜个头就大，所以充分授粉是提高花粉发芽率，增加单瓜重的有效措施。 西瓜的第1雌花结果小并且容易出现畸形果，人工辅助授粉宜选第2~3朵雌花进行。授粉后的花柄处挂上不同颜色的纸牌。授粉工作进行7~8天，纸牌7~8个颜色，可避免遗漏和重复进行。纸牌还可作为采收时的标志。