蛋白质是维持斑点叉尾鮰新陈代谢、正常生长发育的结构物质和主要的能源物质之一，同时作为酶、激素、抗体等的组分参与机体的生理调节功能。斑点叉尾鮰对蛋白质的需要主要由蛋白质的品质决定，同时也受到其他因素的影响，如鱼体大小、水温、池塘中天然食物的多少、养殖密度、日投饲量、饲料中非蛋白能量的数量等因素的影响.当养殖密度较低时,测得其蛋白质需要量为25%-30%,而当密度较高时,则从32%增加到45%,生长速度和饲料转化效率均提高.在实验室环境中测得饲料中适宜的蛋白质含量为25%-36%.
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