1.母猪原因
母猪的乳汁质量不好，过浓或过稀或受感染后乳中带菌。另外母猪粪便中含有大量的大肠杆菌而导致仔猪接触后受感染。
2.细菌原因
大肠杆菌、沙门氏菌以及C型魏氏梭菌素都可引起仔猪腹泻的发
生，可用抗生素治疗。
3.病毒原因
轮状病毒和冠状病毒可导致腹泻，但无有效药物治疗，抗生素只能防止继发感染。
4.营养性原因
植物性饲料如其中含的豆粕可使仔猪肠道致敏。如果乳猪料中豆粕用量过大，势必加剧肠道过敏而引起腹泻，这就是为什么有些乳猪料粗蛋白含量低，但腹泻发生率低。但粗蛋白含量低（18％）的乳猪料不能满足乳猪断奶后快速生长发育的需求。所以乳猪料中应含有除豆粕外的优质蛋白质原料。另外要争取早日补料，让消化道适应植物性饲料的变化。
5.环境原因
产仔舍内卫生条件差，潮湿、温度变化大，小环境条件恶劣等也可引起仔猪腹泻的发生。
1）初生仔猪免疫系统发育不完善。仔猪在母体中通过胎盘获取营养，出生后只有通过吃到初乳获得免疫球蛋白才能产生免疫力，但这种免疫力比较弱，对外界各种病原微生物的侵袭不能产生较强的免疫力，因而易导致初生仔猪发生腹泻。
（2）初生仔猪因为神经系统发育尚未完全成熟，皮下脂肪少，被毛较短，对温度的调节能力较弱，所以当气温突然变化、贼风侵袭、仔猪舍温度过高或过低时可导致仔猪抵抗力下降，此时其肠道内病原微生物的大量繁殖会引起仔猪腹泻。
（3）新生仔猪消化器官不发达，消化功能不完善，消化酶不足，若仔猪日粮中蛋白质水平过高，未完全消化的蛋白质进入肠道后，可导致胃肠功能紊乱，发生消化不良性腹泻。
（4）仔猪早期断奶，母猪和仔猪突然分开，环境变化、饲料变化等原因引起仔猪发生应激反应，导致抗病力下降而发生腹泻。
（5）母猪产后无奶或乳汁过浓、过稀均可导致仔猪腹泻。母猪无奶，仔猪不能及时吃到初乳，获取母源抗体；乳汁过浓，脂肪和蛋白质过高，仔猪易消化不良；乳汁过稀，营养不全，缺少某些矿物质、维生素等营养因子而引起仔猪腹泻。
（6）由细菌性病原而致腹泻。大肠杆菌可引起1~7日龄仔猪黄痢、10~30日龄仔猪发生白痢，C型魏氏梭菌可引起1~3日龄仔猪发生红痢，沙门氏杆菌可引起仔猪副伤寒，猪痢疾密螺旋体可引起50~90日龄的仔猪泻痢。
（7）因病毒性病原而引起的腹泻。包括猪传染性胃肠炎、猪流行性腹泻、轮状病毒和猪伪狂犬病。猪传染性胃肠炎和猪流行性腹泻多发生于冬、春季，感病的仔猪死亡率高达50%~80%;伪狂犬病可引起断奶仔猪发病死亡；轮状病毒在寒冷季节常与仔猪白痢混合感染，多发生于2月龄以内的仔猪。
（8）因寄生虫病引起的腹泻。主要是艾美属和等孢子属的球虫和猪蛔虫、食道口线虫、毛尾线虫、类原线虫等线虫寄生在消化道内引起仔猪腹泻。
引起仔猪腹泻的原因非常复杂，主要有：①致病性大肠杆菌引起的腹泻；②仔猪断奶后，母源抗体急剧下降，造成抵抗力下降；③仔猪的消化机能不健全，高植物蛋白的饲料引起胃肠道机能紊乱；④断奶后的应激，尤其是环境应激，如温差超过10℃时，腹泻率就会增加25％－30％，湿度过高也会增加腹泻的次数；⑤饲喂方式不当，如过度限饲或过度饲喂会引起饥饿性和过食性腹泻；⑥肠道发生的免疫反应。仔猪断奶后即切断了从母体获得被动免疫的来源，但由于主动免疫，尤其是特异性免疫系统功能还未完全有效地建立起来，IgA＋B细胞占主要地位要在4周龄时才能达到成年猪水平，而IgM＋细胞要到3－4月龄才达到成年猪水平。一旦开始饲喂含有大量植物蛋白的玉米—豆粕型日粮，断奶仔猪就会发生肠道免疫反应，出现腹泻现象。
猪轮状病毒感染、猪流行性腹泻、猪传染性胃肠炎、猪血痢、仔猪副伤寒、仔猪红痢、仔猪白痢、仔猪黄痢.
引起仔猪腹泻的传染性因素主要是指传染性病原，其中病毒主要有猪传染性胃肠炎病毒和轮状病毒；细菌主要有大肠杆菌、沙门氏菌和魏氏梭菌等。