油菜耐旱性较差，移栽的油菜根系分布较浅，如果冬季水分不足，在干冻的条件下，根、叶生长和花芽分化都受到阻碍。直播油菜遇干旱，出苗不齐，缺苗断垄严重。一般秋冬干旱，气温高，蚜虫多，危害严重，如不及时抗旱会造成死苗、缺棵，影响产量。在移栽时普遍浇足定根水，有的连续浇2～3次，有的兼施少量粪肥兑水浇施效果更好。旱情严重的时候，采用沟灌抗旱，将水引灌在畦沟，灌水到沟深的2/3，不淹畦面，慢慢渗入土中，浸透以后立即将沟内的余水排干，并在土壤干湿适宜的时候松土保墒，可以较长时间起到抗旱作用。切忌淹灌、漫灌和久灌，以免土壤缺氧；油菜灌水时易出现土体下沉、伤害根系，最好采取淋水的方法，并结合施肥一并进行。对引水抗旱确有困难的旱地油菜麦秸秆、树叶等覆盖行间，以减少土壤水分蒸发，提高抗旱能力，且预防冻害。
长江中下游地区春季一般雨水偏多，油菜地里长期出现高温多湿的环境，病菌生长繁殖快，容易发生菌核病、霜霉病和白锈病，因此油菜春后生长时期的排水防渍工作不能忽视。无论是水田和旱地，移栽或直播的油菜，都要有畦沟，以利于排水，尤其是晚稻茬的油菜田，晒土时间短，土壤结构差，更要深沟窄畦，降雨前后都要进行清沟排渍。