该病的发生与温湿度密切相关，地温20℃左右开始出现症状，地温上升到25～28℃出现发病高峰，地温高于33℃时，病菌的生长发育受抑或出现暂时隐症，进入秋季，地温降至25℃左右时，又会出现第二次发病高峰。夏季大雨或暴雨后，地温下降易发病。地势低洼、土壤粘重、偏碱、排水不良或偏施、过施氮肥或施用了未充分腐熟带菌的有机肥或根结线虫多的棉田发病重
棉花红叶茎枯病是一种生理性病害，是棉花中后期的主要病害之一，沙壤土和瘠薄棉田发生较重，在干旱年份，尤其在久旱逢雨或连阴雨天气，红叶茎枯病暴发，棉株干枯死亡，该病危害胜过其他病害所造成的损失。
暴雨后土壤中盐浓度含量高，再追施尿素害害相加会烧死根系的。
最近有不少棉农打电话咨询，追施尿素以后，棉花出现死棵现象，不是施肥的问题，而是棉花上得了棉花枯黄萎病
暴雨后，地温下降易发病。地势低洼、土壤粘重、偏碱、排水不良或偏施、过施氮肥或施用了未充分腐熟带菌的有机肥或根结线虫多的棉田发病重
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