洋葱黑斑病在寒冷地区病残体在土壤中越冬后以子囊孢子进行初侵染，而后则产生分生孢子，进行再侵染时是借风传播。在温暖地区，主要是靠分生孢子反复侵染蔓延。在长势不良、管理不善的田块易发病，因受冻害造成长势不良时，也会感病。
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