专业合作社普遍存在“六不”的问题：一是发展布局不平衡。有的乡镇发展到8个农机专业合作社，一个村就有3个合作社，而有4个乡镇仍未发展一个合作社；二是登记手续不完善。只有营业执照，其它证件都没有的合作社就有17家，营业执照超过有效期的达21家，营业执照、组织代码证、税务登记证、银行开户证、章程五证齐全的只有7家；三是服务主体不对口。农机专业合作社是指在农机服务范围从事农机作业、运输、中介等专业服务内容，而有的合作社则是从事水利、林业和养殖等专业内容服务，服务对象主体不对口；四是经营规模不达标。有的农机专业合作社是实质上的“皮包合作社”，人社凭的是口头协议，实际上作业不参与、利益不沾边，甚至有的机主“一女二嫁”，卖“空头人情”，合作社形同虚有，根本谈不上经营规模，难以在市场经济运作中承担风险，发挥主力军的作用；五是设施条件不具备。目前大多数农机专业合作社没有固定的场所和必备的设施，可以说是机无库，具无棚，场所就在自家院，应付检查凭口说，滥竽充数不扎实；六是规章制度不健全。多数合作社各种规章制度不健全，或者是贴在墙上、说在纸上，落实不在工作中。