以草鱼烂鳃为例 1 细菌性烂鳃 1）外用二氧化氯（100-300克/亩）、三氯异氰尿酸或溴氯海因对水体消毒1-2次，同时内服诺氟沙星。
2） 苯扎溴铵1瓶（45%，100ml）2亩/米，浓戊二醛1瓶(20%，500ml)2亩/米，加水混合全池泼洒。水色清淡的塘减量，每瓶用3亩/米。严重时连用两天。同时内服超微粉碎三黄散100g-150g+10%氟苯尼考200g或者10%恩诺沙星200g，连用3-7天。根据情况可适量加多维和免疫多糖增强体质，加快恢复。
2 由鳃霉引起的鳃病；每亩水体用二氧化氯150-200克，溶解后全池泼洒；同时，每亩水体使用食盐2公斤，然后内服五倍子末，每1kg饲料拌用4g，混匀后拌饲投喂，1天1次，连用3-5天。
3 由寄生虫引起的鳃病治疗：中华鳋可以使用敌百虫或辛硫磷杀灭；车轮虫、斜管虫可以使用硫酸铜、硫酸亚铁粉或阿维菌素等
根据草鱼烂鳃病的发病原因，对症用药，粘细菌引起的烂鳃病，每亩用生石灰20～30千克或漂白粉1千克，全池泼洒；原生动物引起的烂鳃病，每亩用硫酸铜1.5千克和硫酸亚铁0.5千克，混合后全池泼洒；中华鲺引起的烂鳃病，可用晶体敌百虫兑水后全池泼洒，效果良好。