1、小麦纹枯病从小麦苗期至抽穗期均能发生。苗期的症状主要表现在地下部分，出苗后危害小麦的地下茎，出现褐色病斑，或椭圆形病斑，并向上发展。返青至拔节期田间病株率达5%时，应立即用药进行防治，每亩用20％粉锈宁可湿性粉剂75克或20％井冈霉素40克对水50公斤顺垄喷施，效果很好。?xml:namespace>
2、小麦全蚀病是一种根腐和基腐性病害，在小麦全生育期均可发病，病菌只侵染根部和茎基部1－2节。小麦全蚀病可随种子远距离传播，小麦出苗后开始发病，形成黑根，返青后病害扩展，抽穗后病株成簇或点片状发生早枯白穗，病根变黑，易于拔起。黑脚”和“白穗”成株期所特有的症状。
3、对全蚀病高发区，在小麦拔节期可用小麦全蚀净喷洒1～2次，喷洒浓度是20～25克小麦全蚀净对水15公斤。或采用灌根，可采用工农－16型喷雾器，去掉喷头用纱布包喷头，打小气流，沿麦垄对着根部浇灌。用20％三唑酮乳油每亩l00毫升对水50千克灌根，也有一定的防治效果。
4、小麦根腐病：发病初期根部产生褐色或黑色病斑，叶鞘变褐，严重时根系腐烂，造成死苗。预防根腐病，可在小麦返青前，选择晴天下午进行镇压、锄划，增温保墒促进根系发育。发病地块应及时用药进行防治，可亩用15%三唑酮可湿性粉剂100克或50%多菌灵可湿性粉剂100克对水40-50公斤对小麦茎基部喷雾进行防治。
一、农业措施
1、选用抗耐病品种。目前生产上还没有发现抗根病品种，但品种间抗性存在差异。因此，生产上因地制宜地选种抗耐病品种，对防病可起到良好的作用。
2、轮作倒茬。根病是土传病害，由于长期施行小麦--玉米一年两作制，导致病菌在土壤中大量积累，实行轮作倒茬能有效减轻病害的发生。轮作方式应坚持1-2年换种一次非寄主作物。棉麦两熟轮作，小麦、玉米、花生两年三作制，小麦与蔬菜、绿肥等作物轮作均有良好的控制病害的效果。
3、增施有机肥。化肥的长期过量施用，导致土壤板结、透气性差。增施有机肥，可为小麦提供较全面的营养，发挥小麦植株抗病性，改善土壤理化特性，促进土壤微生物活动，增强微生物间的竞争性，可有效降低发病率。可亩用4500公斤以上充分腐熟的有机肥。
4、适期晚播。播种期的早晚显著影响病害的发生程度。据调查，播种越早，发病越重。播种越早，冬前有效积温愈高，植株群体加大，田间环境条件有利于病菌的生长和侵染，病菌侵染早，侵染期长，导致病情基数高。适期晚播，能减轻病害的发生。
5、精量播种。播种量对根病发生有明显影响。播种量大，小麦群体密度过高，通风透光条件差，有利于病菌的繁殖生长，合理控制播种量，建立合理群体，壮个体，改善田间生态环境，能控制病害发生。提倡精量播种。
6、合理施肥。保持N、P、K的适宜比例，对控制病害的发生尤为重要。N、P、K肥比例失调的田块，特别是施N过量和晚施N田块，麦株旺长，组织柔嫩，降低了植株的抗病性。土壤中缺P甚至过量施P能促进根系发育，适量施N有利于发挥P的作用。增施K肥不仅有增强抗病性，减轻病害发生的作用，而且土壤中缺K肥时，增施K肥还有提高N肥利用率的作用，明显促进生长和增产。增施Zn肥，能够调节土壤pH值，抑制病菌繁殖。
7、田间杂草。田间杂草危害严重的地块，不仅田间通风透光差，湿度大，有利于病菌滋生与繁殖以及病害的发生与蔓延，而且杂草与作物争肥争空间，田间郁蔽，造成植株长势差，抗逆性降低。据调查在相同栽培条件下，杂草密度为2.7株/平方米的田块，纹枯病的病情指数为9.92，病茎率为3.51%，而杂草密度为26.4株/平方米的田块，病情指数达29.22，病茎率高达50.63%。不论用人工或化学除草，都可以明显地减轻根病的发生程度，而且冬前除草效果显著好于春季除草。
8、田间排水。麦田排水的好坏，可直接影响发病的轻重。排水不良、地势低洼的麦田，土壤湿度大，病菌生长量大，麦子长势差，抗病力弱，发病严重；田间湿度低，不利于病菌的生长繁殖，麦子发育正常，发病轻。
二、化学防治
三唑类内吸杀菌剂拌种能有效控制冬前病害的危害，延缓并降低拔节期的发病高峰，药剂有效期一般可达4月上旬。三唑类杀菌剂有生长调节作用，拌种麦苗生长健壮，成穗数和千粒重显著增加，增产幅度可达10%-20%。三唑酮、三唑醇以种子重量0.03%的药量(有效成分)，烯唑醇以0.01%的药量(有效成分)进行拌种，另外，利克菌以0.1%的药量拌种都可有效控制病害。