一般10℃是叶锈菌能否侵入的临界温度，常年春季到达这一温度的一旬及其前后各一旬的这一月为临界时期。临界时期温度回升早晚和雨量多少，是叶锈病本地菌源能否引起流行的决定因素。温度回升早且有雨露配合，叶锈病则提早发展，发病较重。小麦生长中后期，以湿度对病害的影响较大，小麦抽穗前后，如降雨次数多，病害即可流行。
该菌夏孢子萌发后产生芽管从叶片气孔侵入，气温20—25℃经6天潜育，在叶面上产生夏孢子堆和夏孢子，进行多次重复侵染。秋苗发病后，病菌以菌丝体潜伏在叶片内或少量以夏孢子越冬，冬季温暖地区，病菌不断传播蔓延。北方春麦区，由于病菌不能在当地越冬，病菌则从外地传来，引起发病。冬小麦播种早，出苗早发病重。一般9月上、中旬播种的易发病，冬季气温高，雪层厚，覆雪时间长，土壤湿度大发病重。毒性强的小种多，能使小麦抗病性“丧失”，造成大面积发病。