1、肥料产业结构调整，复混肥项目过快过多建设，是影响市场低迷的根本原因。传统大型复合肥企业看到有机-无机复混肥的巨大利润空间和较低的投入成本，纷纷上马有机-无机复混肥项目，凭借技术、设备和销售网络、品牌等优势，在市场上形成较大冲力。市场产品日趋增多，相互竞争加剧，而市场接受度和需求份额相对固定。产品更新换代加快，产品成分、销售价格日益透明。与有机-无机复混肥刚兴起时相比，目前利润空间，已出现大幅度萎缩。
2、经销商出于趋利心理，将高氮高钾复合肥搭配有机肥一起销售，而不乐意只推有机-无机复混肥。由于长期偏施氮肥，土壤含氮量普遍偏高。有机-无机复混肥刚开始推广时，土壤中不缺大量元素而缺复混肥中的有机质和中微量元素等，缺啥补啥，所以使用后效果特别明显。但是，有些地块用了几年有机-无机复混肥后，现在又处于缺氮缺钾状态，又反过来需要复合肥来补充了。
3、低质甚至劣质产品过多充斥市场，造成部分地区老百姓对此类产品一概不买账不认可。相比复合肥准入门槛，有机-无机复混肥生产进入门槛低，产品质量良莠不齐。原料来源更加多样，质量有优有劣，发酵方式严谨与否和机械化程度等都是影响肥料质量的重要因素。
4、一方面是现有产能没有完全释放；一方面是新建扩能项目又不断上马，磷复肥行业产能严重过剩、供需矛盾日益加剧，赔本赚吆喝的困局进一步显现。企业的产销量上去了，而利润却没有水涨船高，甚至出现大面积亏损，行业生存环境比较艰难。我国每年有70%以上的磷复肥产能处于闲置状态，过于庞大的闲置产能带来了全行业的低迷。加之磷复肥行业门槛低、技术要求不高，导致行业集中度低下、企业众多且水平参差不齐。近两年来，磷复肥企业各自为战，有的厂家停业关门，有的企业限产、减产，大部分磷复肥企业都在叫苦，虽然不少企业的销量每年都在上升，然而整体盈利水平下降却是企业的一块心病。
5、由于当前产能过剩所带来的混战已进入白热化程度，有些企业完全没有特色，既不靠近资源地，在消费地又没有优势。这些小企业加入复混肥行业已经完全没有必要，只会加剧行业竞争。企业应该转变发展方式，让行业内大量的闲置产能得到充分利用，不要再依靠新建产能的扩张来发展。