选对产品：一般的化学药品用下去会刺激小瓜虫繁殖速度变快，药物更难渗透。业内人士建议用内服青蒿末来进行处理。青蒿末在鱼的血液体液中产生的药物浓度，当鱼体血液里产生药物浓度后，寄生虫就会被迫自主离开鱼体。一旦离开鱼体后，寄生虫在水体中长时间找不到寄主就会自行死亡，同时保证脱离鱼体后水体中也有一定的青蒿末浓度，这样持续的杀灭方法才能达到根治的目的。内服时间3-5天，同时外用驱虫药物2次，效果显着。
注意事项：小瓜虫在晚上时为最薄弱的时候，所以内服一般在下午5点后投喂，外用在夜晚10点泼洒。
关于海水网箱养殖鱼类小瓜虫更难处理，原因是由于海水网箱处于一个开放空间，每个养殖排之间不能很好隔绝，这个养殖户用药了，小瓜虫便跑到隔壁另一个养殖户网箱了，等隔壁网箱用药时它又跑回来，如此反复……所以最好的办法是，大家一起同时杀虫治疗！
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