培养基与菌种分离是指从含有多种微生物的样品中获得纯种微生物的操作技术。菌种分离主要在培养皿上进行,常用的方法是稀释法和划线法。使用这两种方法的目的是是微生物的一个个体通过繁殖,在固体培养基上长出肉眼能见的群体,然后根据培养特征,用接种针调取所需菌种并在显微镜下检查,证明为单一形状的菌体。常用的培养基是选择培养基。如分离分解纤维素的微生物用的培养基是以纤维素为碳源的培养基,因为从这种培养基上长出来的只能是分解纤维素的微生物。改变培养基条件也有助于菌种分离。如为了得到嗜热微生物,可以在50℃~60℃下对微生物进行培养。有时投加相应的抑制剂也能提高菌种分离效果,如在土壤样品的悬浮液中投加10%的苯酚数滴,可以抑制霉菌和细菌的生长,而有利于放线菌的分离。在培养基中投加一定量的青霉素或链霉素能抑制细菌的生长,而有利于霉菌的分离。
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