1) 高浓度化肥造成土壤板结和盐渍化;土壤中活跃的一价钠、钾、铵离子很容易置换掉土壤中有机无机胶体复合体起搭桥物质的两价的阳离子钙、镁、锰、亚铁,这样就破坏了土壤的团粒结构。往往因为过量施入含一价阳离子的肥料进入土体,造成更严重的破坏。2)高浓度化肥导致新型连作障碍;化肥施到农田后,速效养分瞬间完成与土壤颗粒的结合,多余的养分不能被土壤颗粒吸持的部分,就溶解在土壤水溶液中;土壤溶液中过多营养导致植物奢侈吸收,这些阳离子使植物液泡pH值升高,pH值高于4.2时就为某些细菌的存活创造了条件;生产上普遍出现新型的连作障碍就是这个原因。
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