南瓜的根系发达，主根人土深达两米左右。一级侧根有20余条，一般长50厘米左右，并可分生3--4级侧根，形成强大的根群.主要根群分布在10-40厘米的耕层内，由于南瓜根系强大，在早田或府薄的土壤中均能正常生长。
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