一、症状：通常病部仅局限于根部和茎基部，尤其是在刚定植完至开花坐果这段时间容易发生。发病初期植株缓苗慢，发育不良，后期病株白天萎蔫，傍晚和次日清晨尚可恢复，反复多日后植株枯死。病株茎基部及根部皮层变为褐色至深褐色，呈湿腐状。最后病部缢缩、腐烂，皮层易剥离，露出暗褐色的木质部。
二、防治方法：
1.与非茄科蔬菜进行三年以上的轮作。
2.加强栽培管理。采用起垄栽培，避免大水漫灌，保持根茎部土壤干燥。
3.药剂防治：发病初期喷洒或浇灌50%甲基硫菌灵-硫磺悬浮剂800倍液，或50%根腐灵可湿性粉剂800倍液或10%双效灵水剂200—300倍液，或75%敌克松可湿性粉剂800倍液，每十天一次，连续2—3次。
主要为害甜、辣椒茎基部及维管束，病株部分枝和叶片变黄萎蔫，茎内维管束褐变，湿度大或生育后期茎基部或根茎部腐烂，有时可见粉红色菌丝及点状粘质物，即病原菌分生孢子梗和分生孢子。此外，木贼镰刀菌等侵染幼苗的根茎部时，也可引起种子腐烂或幼苗猝倒；串珠镰刀菌侵染后种子发芽率下降40%左右，或形成不正常幼苗，如子叶和种皮被菌丝包被，使种皮无法脱落，子叶不能伸展；尖镰孢菌侵染种子后，发芽率下降62%，幼苗矮化、茎部缢缩、弯曲或子叶垂萎等畸形症状，拔出幼苗，主根变为黄褐色，次生根坏死脱落；茄腐镰刀菌侵染种子后，发芽率降低52%，病菌首先侵染根及根茎部，初为水浸状，后腐烂，致幼苗枯死或矮化。
农业防治
(1)精选品种。选好并整好育苗地块。选择优质品种，并对种子进行浸种+ 种衣剂处理，并适期播种。
(2)实行与豆科、禾本科作物进行3～5年轮作。
(3)田间管理。①精耕细整土地，悉心培育壮苗，在移植时尽量不伤根，精心整理，保证不积水沤根，施足基肥。②定植后要根据气温变化，适时适量浇水，防止地上水分蒸发、苗体水分蒸腾，隔绝病毒感染。要喷施促花王3号，促花芽分化，多开花，多坐果。 ③分别在花蕾期、幼果期、果实膨大期喷施辣椒壮蒂灵，增强植株营养匹配功能，使果蒂增粗，促椒体健康生长，增强抗病能力。
(4)定植后温度控制在20～30℃、地温25℃、湿度不高于90%。使幼苗茁壮成长。
一、症状
辣椒根腐病多发生于定植后。发病初期病株枝叶特别是顶部叶片稍见萎蔫，傍晚至次日早晨恢复，症状反复数日后叶片全部萎蔫，但叶片仍呈绿色。病株的根茎部及根部皮层呈淡褐色及深褐色腐烂，极易剥离，露出木质部；横切茎观察，可见维管束变褐色，后期潮湿时可见病部长出白色至粉红色霉层。
二、防治
1.轮作换茬。与大白菜、甘蓝、大蒜、大葱等作物实行5年以上的轮作。
2.杜绝初侵染源。一般情况辣椒苗要自己育，如需要购买苗子，绝对不要在发病区购买，以有效杜绝因购买苗子而引起辣椒根腐病的传播发生。
3.科学管理，防止积水。整地时一头要挖好排水沟；采用垄栽，做成90厘米宽的高垄，一垄栽双行，既利于提早封垄，又利于通风采光和田间管理；使用充分腐熟的有机肥，中后期追肥，采用配制好的复合肥母液随浇水时浇施，或顺垄撒施后浇水，防止人为管理造成辣椒根部受伤。
4.病株处理。如在辣椒田里发现一株或几株出现中午萎蔫，晚上稍恢复的情况，就应立即拔除，带出田外烧掉，然后用土拌石灰掩埋辣椒病穴。
5.加强栽培管理。据调查，同一地块高垄栽培比低垄栽培明显发病轻，用塑料薄膜覆盖发病轻，因此建议菜农应高垄栽培并用塑料薄膜覆盖。不要大水漫灌，有条件可进行滴灌，保持土壤半干半湿状态，及时增施磷钾肥，增强抗病力。
6.药剂防治。稼稼乐根苗康：专治根部与苗期病害，效果棒棒的，20ml一壶水，一瓶一壶水 用于苗期 喷施或拌种.稼稼乐抗茬宝，与化肥农家肥混合均匀施入土壤，大田1-2袋/亩，经济作物2-3袋/亩，淋施、滴灌、冲施 中后期也可使用。