防治纹枯病，应在水稻未发病时开始预防，在水稻含苞至抽穗期间防治最好。
在治虫时，配虫药时加入井冈霉素、三唑酮，或纹枯净、纹曲清、稻纹灵、纹真清、纹剑等等之类的治纹枯病的药一同喷洒。另外如有时间的话，可以在未耕种前进行打捞菌核，减少菌源。插播秧苗不能太密，田里浅水勤灌，少施氮肥
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