南瓜炭疽病病菌主要以菌丝体或拟菌核在种子上，或随病残株在田间越冬，翌年条件适宜时，产生大量分生孢子，成为初侵染源。病菌分生孢子通过雨水传播，孢子萌发适温22~27℃，病菌生长适温24℃，8℃以下，30℃以上即停止生长。
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