所谓种球处理就是将采收后的商品种球，在适宜低温下贮藏足够的时间，以解除百合休眠，完成花芽分化。
将清理分级后的种球阴凉2—3天后，用杀菌剂(80倍福尔马林水溶液)浸泡30分钟再用清水洗净阴干备用。用塑料箱做贮藏容器，先在箱内铺一层塑料膜，撤一层湿锯末，放一层百合种球。锯末厚度约为种球直径、直到放满箱子，将塑料膜包扎，上面打一些小洞透气，然后堆放于冷库中先进行冷冻处理。亚洲型百合一2℃，东方型及麝香型百合一1．5℃，在该条件下百合种球可以贮藏达30周。
注意：冷冻处理中应保持温度的恒定，很小的温度差异邦可能引起冻害或发芽，一旦解冻后必须进行催根定植，不可二次冷冻。
播种前将冻藏种球在10一15℃环境中缓慢解冻．并将塑料包装汀开。解冻后置3—5℃环境中，亚洲型百合4—6周，东方型及麝香型百合约10一12周。种植前还应将经处理种球整箱置于10—17℃环境今催根，至每个种球发出4—6条根即可定植.
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